Європейський Університет у Кракові пропонує два факультети: прикладних наук і пізнання та суспільної комунікації. На їх базі діє більш ніж 20 спеціальностей, наприклад, менеджмент, графіка, цифрове мистецтво, гейм-дизайн, а також різні філологічні напрями. Саме ці сфери найчастіше обирають іноземні абітурієнти.
Особливістю ВНЗ є викладання скандинавських мов — норвезької та шведської. Крім цього, заклад спеціалізується на графічному дизайні, рекламі та психології управління.
Варто зазначити, що Європейський Університет ім. Юзефа Тішнера в Кракові надає можливість вчитися не лише польською мовою, але й англійською, наприклад, на факультеті психології. А для учасників денної форми організовують безоплатні курси польської мови.
Для тих, хто навчається на двох спеціальностях одночасно або активно працює пропонують індивідуальний план освітнього процесу. Обираючи такий варіант студент відвідує мінімальну кількість лекцій та семінарів, але складає іспити та отримує класичний диплом.